ناقشت أطروحة الدكتوراه في كلية العلوم بجامعة البصرة (عزل وتشخيص الفطريات الداخلية وتقدير تأثيرها وأيوضها الثانوية على بعض الفطريات الممرضة للنبات، وتضمنت رسالة الباحثه (آلاء علاءالدين معتوق الرفاعي) الى معرفه انواع  الفطريات الداخليه في 20 نوع نباتي  كما تعرفت على قابليه هذه الفطريات في تحسين الصفات الحيوية للنبات وحمايته من الامراض؛ حيث تعد الفطريات الداخلية للنبات Endophytic fungi مجموعه من الفطريات المجهرية التي تستعمر وتنمو داخل النباتات السليمة في كل او جزء من دورة حياتها دون ان تسبب أي مرض او ضرر واضح للمضيف؛ كما أظهرت النتائج ومن خلال نتائج التحليل الجيني تسجيل (30) نوعا فطريا جديدا لأول مره في العراق.